通過對物流系統(tǒng)的特征及其安全特性的分析，物流安全的指導(dǎo)思想主要有以下幾方面。
1．系統(tǒng)安全思想
物流是為實(shí)現(xiàn)特定目標(biāo)而由多個(gè)不相同的結(jié)構(gòu)、功能和要素有機(jī)組成的系統(tǒng)。物流系統(tǒng)的組成要素復(fù)雜、多元，要實(shí)現(xiàn)物流系統(tǒng)安全，就必須貫徹系統(tǒng)安全思想，將復(fù)雜的要素以系統(tǒng)的方式進(jìn)行分析，才能實(shí)現(xiàn)物流系統(tǒng)的整體安全，實(shí)現(xiàn)最大的社會和經(jīng)濟(jì)效益。
2．實(shí)踐思想
實(shí)踐觀點(diǎn)是馬克思主義哲學(xué)的理論基礎(chǔ)，其哲學(xué)的根本之點(diǎn)在于：始終站在歷史的基礎(chǔ)上，不是從觀念出發(fā)來解釋實(shí)踐，而是從物質(zhì)出發(fā)解釋觀念的東西。隨著生產(chǎn)方式的變更，人類從農(nóng)牧業(yè)進(jìn)人早期工業(yè)化社會―蒸汽機(jī)時(shí)代。由于事故與災(zāi)害類型的復(fù)雜多樣和事故嚴(yán)重性的擴(kuò)大，人類進(jìn)人局部安全認(rèn)識階段，哲學(xué)上反映出：從事故與災(zāi)難的經(jīng)歷上來認(rèn)識人類安全，有了與事故抗?fàn)幍囊庾R，學(xué)會了“亡羊補(bǔ)牢”的手段，是一種頭痛醫(yī)頭、腳痛醫(yī)腳的對策。如發(fā)生事故后原因不明不放過、當(dāng)事人未受到教育不放過、措施不落實(shí)不放過、責(zé)任人未受到處罰不放過的“四不放過”原則；事故統(tǒng)計(jì)學(xué)的致因理論研究；事故整改對策的完善，管理中的事故賠償與事故保險(xiǎn)制度等事故對策。
3 ．辯證唯物思想
辯證唯物法是馬克思主義哲學(xué)的重要組成部分，是貫徹于全部哲學(xué)理論的靈魂，對安全科學(xué)也具有重要的指導(dǎo)作用。唯物辯證法的三個(gè)基本規(guī)律（對立統(tǒng)一規(guī)律、質(zhì)量互變規(guī)律、否定之否定規(guī)律）和五對范疇（原因和結(jié)果、必然性和偶然性、可能性和實(shí)現(xiàn)性、內(nèi)容和形式、現(xiàn)象和本質(zhì)）對安全科學(xué)的研究進(jìn)步與發(fā)展起到了重要的推動(dòng)作用。例如，安全與事故就是對立統(tǒng)一的兩個(gè)方面，安全是為了不發(fā)生事故，有了事故才需要安全；事故是有其必然性和偶然性的，只要掌握了事故的必然性和偶然性，就能夠有效地防止事故的發(fā)生。在物流安全中，將安全科學(xué)、物流科學(xué)及哲學(xué)的思想綜合運(yùn)用于物流系統(tǒng)，發(fā)掘物流安全的本質(zhì)和普遍規(guī)律，以期產(chǎn)生最大的社會效益和經(jīng)濟(jì)效益。